RESUMEN
BACKGROUND: Monoallelic loss-of-function IKZF1 (IKAROS) variants cause B-cell deficiency or combined immunodeficiency, whereas monoallelic gain-of-function IKZF1 variants have recently been reported to cause hypergammaglobulinemia, abnormal plasma cell differentiation, autoimmune and allergic manifestations, and infections. METHODS: We studied seven relatives with autoimmune/inflammatory diseases and lymphoproliferative diseases. We analysed biopsy results and performed whole-exome sequencing and immunological studies. RESULTS: Disease onset occurred at a mean age of 25.2 years (range: 10-64, years). Six patients suffered from autoimmune/inflammatory diseases, four had confirmed immunoglobulin G4-related disease (IgG4-RD), and five developed B-cell malignancies: lymphoma in four and multiple myeloma in the remaining patient. Patients without immunosuppression were not particularly prone to infectious diseases. Three patients suffered from life-threatening COVID-19 pneumonia, one of whom had autoantibodies neutralizing interferon (IFN)-α. The recently described IKZF1 gain-of-function p.R183H variant was found in the five affected relatives tested and in a six-year-old asymptomatic girl. Immunological analysis revealed hypergammaglobulinemia and high frequencies of certain lymphocyte subsets (exhausted B cells, effector memory CD4 T cells, TEMRA and CD28-CD57+ CD4+ and CD8+ T cells, Th2 and Tfh2 cells) attesting to immune dysregulation. Partial clinical responses to rituximab and corticosteroids were observed, and treatment with lenalidomide, which promotes IKAROS degradation, was initiated in three patients. CONCLUSION: Heterozygosity for gain-of-function IKZF1 variants underlies autoimmunity/inflammatory diseases, IgG4-RD and B-cell malignancies, the onset of which may occur in adulthood. Clinical and immunological data are similar to those for patients with unexplained IgG4-RD. Patients may therefore benefit from treatments inhibiting pathways displaying IKAROS-mediated overactivity.
RESUMEN
RESUMEN Los análisis de ADN antiguo (ADNa) han incrementado en los últimos años permitiendo conocer la diversidad genética de las poblaciones precolombinas. En Colombia, existen pocos registros arqueológicos de la población prehispánica del Norte de Santander habitada en el siglo XVI por el grupo Chitarero. Por este motivo, nos propusimos analizar la diversidad genética a partir de secuencias de la región HVRI del ADNmt y determinar sus posibles relaciones con otras comunidades tanto antiguas como contemporáneas. Se analizaron siete individuos precolombinos asociados a este grupo prehispánico, recuperados en los municipios de Cácota y Silos en el departamento de Norte de Santander de los Andes Orientales colombianos, siguiendo criterios estrictos de autenticidad para el ADNa. En todos los individuos se logró identificar el haplogrupo B caracterizado por el polimorfismo en la posición 16217C, siendo éste uno de los más frecuentes en comunidades precolombinas y contemporáneas de los Andes Suramericanos. Este hallazgo indica que este grupo poblacional se encuentra estrechamente emparentado por línea materna, con posibles índices de endogamia, con una probable densidad demográfica baja y una baja diversidad genética, similares a lo observado en comunidades pertenecientes a periodos anteriores como el Formativo. Este grupo precolombino exhibe una de las diversidades genéticas más bajas reportadas en las poblaciones pertenecientes a la familia lingüistica Chibcha. Estos resultados genéticos coinciden con los planteamientos sobre el grupo Chitarero de pertenecer a comunidades pequeñas independientes, con asentamientos dispersos, apartados unos de otros.
ABSTRACT In the last few years there has been an increase in ancient DNA (aDNA) analyses that has allowed shedding light on the diversity of pre-Columbian populations. In Colombia, there are few archaeological records belonging to the prehispanic population from Norte de Santander inhabited in the XVI century by the Chitarero. For this reason, we performed a genetic diversity analysis of the HVRI region of mtDNA in order to determine their possible relationships with other communities both ancient and contemporary. We analyzed seven pre-Columbian individuals belonging to this pre-Hispanic group, recovered from the municipalities of Cácota and Silos in the department of Norte de Santander located at the Colombian Andes, following strict authenticity criteria for aDNA. All individuals were identified as belonging to haplogroup B, characterized by the polymorphism found at position 16217C which is one of the most frequent haplogroups in pre-Columbian and contemporary communities of the South American Andes. This finding suggests that this population group was closely related through its maternal lineage, with possible inbreeding indexes, low population density and therefore low genetic diversity, similar to what is observed in communities belonging to previous periods such as the Formative period. This pre-Columbian group exhibits one of the lowest genetic diversities reported in populations belonging to the Chibcha linguistic family. These genetic results coincide with the views on the Chitarero group as belonging to small independent communities, with dispersed settlements separated among them.
RESUMEN
Resumen Introducción. El ADN antiguo que se extrae de los restos óseos humanos permite analizar la composición genética de las poblaciones precolombinas y determinar las dinámicas poblacionales que dieron origen a la diversidad de las poblaciones contemporáneas. Objetivo. Determinar la diversidad genética y la relación con otras comunidades contemporáneas y antiguas de América, de los restos óseos asociados al Templo del Sol en Sogamoso, Colombia. Materiales y métodos. Se analizaron 13 individuos pertenecientes al periodo precolombino muisca (siglos IX-XVI d. C.), provenientes de los alrededores del Templo del Sol en Sogamoso, Boyacá, Andes orientales colombianos. Se amplificó el ADN mitocondrial (ADNmt) y se determinaron los polimorfismos de la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP) para los cuatro haplogrupos amerindios (A, B, C y D). Además, se amplificaron y analizaron los marcadores autosómicos, incluida la amelogenina, y los marcadores de los polimorfismos de repeticiones cortas en tándem (Short Tandem Repeat, STR) del cromosoma Y. Resultados. El haplogrupo A fue el linaje mitocondrial más frecuente en esta población, seguido de los haplogrupos B y C; no se detectó el haplogrupo D. Los análisis de variación genética indicaron una diversidad semejante a la de las poblaciones pertenecientes a la familia lingüística chibcha, contemporánea en Colombia y Centroamérica. Se logró hacer la determinación molecular del sexo de los individuos estudiados y compararla con los datos osteológicos. Con una sola excepción, los datos bioantropológicos y moleculares concordaron. Conclusiones. Estos resultados aportan nuevos elementos a la hipótesis del origen centroamericano de los grupos chibchas del altiplano cundiboyacense con base en marcadores genéticos, y permitieron establecer el sexo y las relaciones de parentesco.
Abstract Introduction: DNA extracted from ancient human bones allows to analyze the genetic makeup of preColumbian populations and to determine the dynamics that gave rise to the diversity of contemporary populations. Objective: To determine the genetic diversity of skeletal remains associated with the Templo del Sol (Sun Temple) and their relationship with other contemporary and ancient communities of America. Materials and methods: We analyzed 13 individuals belonging to the pre-Columbian Muisca Period (IX-XVI centuries AD) from the vicinities of the Templo del Sol (Sun Temple) (Sogamoso, Boyacá) in the eastern Colombian Andes. Mitochondrial DNA was amplified and RFLPs were performed in order to type the four traditional Amerindian haplogroups (A, B, C and D). In addition, autosomal markers including amelogenin and Y-chromosome STRs were amplified. Results: Among the observed mitochondrial lineages, haplogroup A was the most frequent, followed by haplogroups B and C; no evidence of haplogroup D was found. The genetic variation analysis indicated a similar diversity of pre-Columbian Muiscas to that of contemporary populations belonging to the Chibcha linguistic family from Colombia and Central America. Molecular sexing was accomplished and it was compared to osteological data. With only one exception, anthropological and molecular data were consistent. Conclusions: Our results contribute new genetic elements supporting the hypothesis of Central American origin of the Chibcha groups of the Cundiboyacense plateau, and allowed sex typing and kinship evaluations.
Asunto(s)
Femenino , Historia Antigua , Historia Medieval , Humanos , Masculino , Variación Genética , ADN Mitocondrial/genética , Indios Sudamericanos/genética , Filogenia , Huesos/química , Haplotipos , Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción , Indios Sudamericanos/historia , Marcadores Genéticos , Análisis de Secuencia de ADN , Colombia , Cromosomas Humanos Y/genética , Amelogenina/genéticaRESUMEN
INTRODUCTION: DNA extracted from ancient human bones allows to analyze the genetic makeup of pre-Columbian populations and to determine the dynamics that gave rise to the diversity of contemporary populations. OBJECTIVE: To determine the genetic diversity of skeletal remains associated with the Templo del Sol (Sun Temple) and their relationship with other contemporary and ancient communities of America. MATERIALS AND METHODS: We analyzed 13 individuals belonging to the pre-Columbian Muisca Period (IX-XVI centuries AD) from the vicinities of the Templo del Sol (Sun Temple) (Sogamoso, Boyacá) in the eastern Colombian Andes. Mitochondrial DNA was amplified and RFLPs were performed in order to type the four traditional Amerindian haplogroups (A, B, C and D). In addition, autosomal markers including amelogenin and Y-chromosome STRs were amplified. RESULTS: Among the observed mitochondrial lineages, haplogroup A was the most frequent, followed by haplogroups B and C; no evidence of haplogroup D was found. The genetic variation analysis indicated a similar diversity of pre-ColumbianMuiscas to that of contemporary populations belonging to the Chibcha linguistic family from Colombia and Central America. Molecular sexing was accomplished and it was compared to osteological data. With only one exception, anthropological and molecular data were consistent. CONCLUSIONS: Our results contribute new genetic elements supporting the hypothesis of Central American origin of the Chibcha groups of the Cundiboyacense plateau, and allowed sex typing and kinship evaluations.
Asunto(s)
ADN Mitocondrial/genética , Variación Genética , Indios Sudamericanos/genética , Amelogenina/genética , Huesos/química , Cromosomas Humanos Y/genética , Colombia , Femenino , Marcadores Genéticos , Haplotipos , Historia Antigua , Historia Medieval , Humanos , Indios Sudamericanos/historia , Masculino , Filogenia , Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción , Análisis de Secuencia de ADNRESUMEN
Ancient DNA was recovered from 17 individuals found in a rock shelter in the district of "La Purnia" (Santander, Colombia). This region is the homeland of pre-Columbian Guane, whom spread over the "Río Suarez" to the "Río de Oro", and were surrounded to the west by the Central Andes, south and east by foothills of Eastern Andes, and north by the "Chicamocha" river canyon. Guanes established in a region that straddles the Andes and the northern Amazon basin, possibly making it an unavoidable conduit for people moving to and from South America. We amplified mtDNA hypervariable region I (HVI) segments from ancient bone remains, and the resulting sequences were compared with both ancient and modern mitochondrial haplogroups from American and non-American populations. Samples showed a distribution of 35% for haplogroup A, 41% for haplogroup B and 24% for haplogroup D. Nine haplotypes were found in 17 samples, indicating an unusually high genetic diversity on a single site ancient population. Among them, three haplotypes have not been previously found in America, two are shared in Asia, and one is a private haplotype. Despite geographical barriers that eventually isolated them, an important influence of gene flow from neighboring pre-Columbian communities, mainly Muiscas, could explain the high genetic polymorphism of this community before the Spanish conquest, and argues against Guanes as being a genetic isolate.
Asunto(s)
Huesos/química , ADN Mitocondrial/genética , Variación Genética , Indios Sudamericanos/genética , Américas , Antropología Física , Colombia , ADN Mitocondrial/análisis , Emigración e Inmigración , Haplotipos , Historia Medieval , Humanos , Indios Sudamericanos/historia , Filogeografía , Análisis de Componente PrincipalRESUMEN
Introducción. Los restos óseos arcaicos son fuente privilegiada de información biológica y su caracterización genética permite confirmar o descartar filiaciones propuestas por otras aproximaciones científicas. La historia precolombina de los Andes orientales se divide en tres periodos principales: I) un poblamiento temprano por parte de grupos cazadores-recolectores; II) un periodo intermedio (Herrera) de pueblos con agricultura incipiente, y III) un periodo tardío de pueblos chibchas, agrícolas y alfareros (agroalfarero). Objetivo. Analizar el ADN mitocondrial de restos óseos del periodo Herrera. Materiales y métodos. Se analizaron 11 individuos pertenecientes al yacimiento arqueológico Madrid 2-41, con una edad aproximada de 2.000 años. Un fragmento (192 pb) del segmento hipervariable I fue amplificado y secuenciado, siguiendo criterios estrictos de autenticidad deADN arcaico. Las secuencias se compararon con las existentes en bases de datos de Norteamérica y Europa usando herramientas bioinformáticas. Resultados. Todas las secuencias resultaron idénticas y fueron clasificadas como haplogrupo B. Esto puede relacionarse con el tipo de entierro ritual practicado en Madrid 2-41, es decir, probablemente los individuos analizados hagan parte de una familia jerárquicamente importanteen la antigua sociedad Herrera. La búsqueda de secuencias homólogas en las bases de datos estadounidense y europea no arrojó coincidencias exactas, aunque existe el reporte de un individuo amazónico de ~4.000 años de antigüedad (Brasil) cuya secuencia coincide con la hallada en Madrid 2-41.Conclusión. Los individuos del yacimiento arqueológico Madrid 2-41 están estrechamente emparentados entre sí por línea materna y presentan una secuencia aparentemente ausente en poblaciones actuales.
Asunto(s)
ADN Mitocondrial/análisis , Arqueología , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Colombia , Haplotipos , MomiasRESUMEN
INTRODUCTION: Ancient bone remains constitute an important source of biological information, and their genetic characterization allows the confirmation or rebuttal of human affiliations proposed on the basis of non-molecular approaches. Pre-Columbian history of the Eastern Andes in Colombia has been divided into three main periods: (i) an early colonization by groups of hunter-gatherers, (ii) an intermediate period "Herrera" characterized by primitive agriculture and (iii) a late stage of Chibcha-speaking groups, with agriculture and ceramics ("agroalfarero"). OBJECTIVE: The mitochondrial DNA on ancient bone remains of the Herrera period were analyzed for comparison with modern and other ancient DNAs. MATERIALS AND METHODS: Mitochondrial DNA was extracted from 11 Herrera individuals [approximately 2,000 years before present (YBP)] found in the Madrid 2-41 archaeological site near Bogotá, Colombia. A 192 bp segment of the hypervariable segment I was amplified and sequenced, following stringent archaic DNA authenticity criteria. The sequences were compared with those in American and European databases using bioinformatics tools. RESULTS: All individuals had identical sequences and were classified as haplogroup B. This identity may be related to the type of ritual burial performed in the site, probably exclusively for members of a hierarchically important family of the ancient Herrera society. The search for homologous sequences in the American and European mtDNA data bases produced no identical coincidences, although a Brazilian Amazonic individual (approximately 4,000 YBP) was recorded with a matching sequence. CONCLUSION: Individuals buried in the Madrid 2-41 site were maternally closely related and showed a mtDNA sequence that is apparently absent in contemporary populations.
Asunto(s)
Huesos , ADN Mitocondrial/análisis , Fósiles , Paleontología , Análisis de Secuencia de ADN , Arqueología , Secuencia de Bases , Huesos/citología , Huesos/fisiología , Colombia , Biología Computacional , Bases de Datos de Ácidos Nucleicos , Haplotipos , Historia Antigua , Humanos , Polimorfismo GenéticoRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Procedimientos Quirúrgicos Urológicos/métodos , Cistectomía/métodos , Neoplasias de la Vejiga Urinaria/cirugía , Complicaciones Intraoperatorias/epidemiologíaRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Contracción Muscular , Litotricia/métodos , Procedimientos Quirúrgicos Urológicos/métodos , Cálculos de la Vejiga Urinaria/terapia , Complicaciones Intraoperatorias/terapia , Rotura/terapiaRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Masculino , Humanos , Prostatectomía/métodos , Neoplasias de la Próstata/cirugía , Resección Transuretral de la Próstata , Anestesia/métodos , Complicaciones Intraoperatorias , Neoplasias de la Vejiga Urinaria/cirugíaRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Masculino , Humanos , Prostatectomía/métodos , Neoplasias de la Próstata/cirugía , Complicaciones Intraoperatorias , Resección Transuretral de la Próstata , Hemorragia Posoperatoria , Erección Peniana , Esclerosis/prevención & control , Enfermedad Iatrogénica/prevención & control , Incontinencia Urinaria/prevención & controlRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Estrechez Uretral/cirugía , Ureteroscopía/métodos , Cateterismo Urinario/métodos , Esclerosis/prevención & control , Resección Transuretral de la Próstata/efectos adversos , Vejiga Urinaria/lesionesRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Estrechez Uretral/cirugía , Cateterismo Urinario/métodos , Ureteroscopía/métodos , Uretra/lesiones , Complicaciones IntraoperatoriasRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Ureterocele/cirugía , Urotelio/cirugía , Neoplasias Ureterales/cirugía , Urotelio/patología , Ureteroscopía/métodos , Cálculos Ureterales/cirugíaRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Ureteroscopía/métodos , Enfermedades Ureterales/cirugía , UreteroscopiosRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Ureteroscopía/métodos , Cálculos Ureterales/cirugía , Litotricia/métodos , Ureteroscopios , Neoplasias Ureterales/cirugíaRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Obstrucción Ureteral/cirugía , Ureteroscopía/métodos , Cateterismo Urinario/métodos , UreteroscopiosRESUMEN
No disponible
Asunto(s)
Humanos , Nefrostomía Percutánea/métodos , Neoplasias Renales/cirugía , Endoscopía/métodosRESUMEN
Objetivos: Determinar la prevalencia y variabilidad de ocho rasgos morfológicos dentales: incisivos en pala (UI1), cúspide de Carabelli (UM1), reducción del hipocono (UM2), cresta distal del trigónido (LM1), cúspide sexta TAPI (LM1), cúspide séptima TAMI (LM1), pliegue acodado (LM1) y protostílido (LM1). Materiales y métodos: Se realizó un estudio descriptivo transversal cuantitativo para caracterizar la morfología dental mediante el sistema de placas ASU, en 100 jóvenes de ambos sexos pertenecientes al grupo poblacional mestizo, estudiantes de tres colegios de Cali y con edades comprendidas entre los 10 y 18 años. Resultados: Los rasgos de mayor prevalencia fueron la reducción del hipocono y el pliegue acodado. Se apreciaron frecuencias bajas de los incisivos en pala, cúspide de Carabelli, protostílido, cúspide 6, cúspide 7. No se observó en la muestra la cresta distal del trigónido. Los resultados indican que existe bilateralidad en la expresión de los rasgos y que estos no presentan dimorfismo sexual; además la prevalencia de algunos de ellos sugiere que la muestra observada tiene semejanza con el patrón dental caucasoide y preserva algún tipo de influencia del complejo dental mongoloide
